Die LVHS Niederalteich wurde durch das Hochwasser im Jahr 2013 stark beschädigt. Die Wiederherstellung der Bestandsgebäude war so zu organisieren, dass bei einem wiederkehrendem Hochwasser die Schäden künftig möglichst gering ausfallen. In diesem Zuge wurden auch Mängel im Brandschutz behoben. Da künftig die Kellerräume nicht mehr genutzt werden sollen, entstanden Ausweichflächen in zwei ellipsenförmigen Neubauten.